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structure軟體文件格式

發布時間:2022-10-26 03:03:56

⑴ ansys structure 怎麼存

1、打開ansysstructure軟體,並進行建模分析,繪制出雲圖。
2、依次點擊上方菜單彈出列印窗口。
3、在列印窗口中,選擇虛擬列印機,點擊「列印」按鈕。
4、接著彈出虛擬列印機的提示窗口,點擊保存按鈕後,即可將ansysstructure模型保存為PDF格式文件。
5、然後使用閱讀器,即可打開ansysstructure保存後的模型文件。

⑵ tekla structures 怎麼才能輸出STP格式

軟體本身不能輸出STP格式的文件,需要TEKLA STRUCTURES CONVERTER 轉換器
如您是正版用戶請訪問在線技術支持進行下載。

⑶ 群體結構分析軟體Structure了解和使用

Structure 是一個利用遺傳標記推斷群體遺傳結構的軟體。其功能包括推斷群體數目,判斷某個個體屬於哪個群體,鑒別遷移個體及雜合體等。舉個例子

上圖中顏色的種類即表示群體的數目,也就是說,2種顏色表示該例中的所有樣本可以分為2個群體。不同的顏色表示不同的「血統」,或者說,來自於不同的祖先群體。其中每一個黃藍相間的堆疊圖表示一個個體。圖中的下標「LF」,「CR」等表示種源地。那麼,在本例中,藍色區域中的個體就可以歸為一個群體,而黃色區域內的個體就屬於另一個群體,因為這些個體擁有相同的「血統」,盡管它們來自於不同的種源地。
就像亞洲人和歐洲人分屬於不同的群體,通俗的講,我們和歐洲人「血統」不一樣。從基因的層面去解釋,則是因為我們之間等位基因頻率有很大差異,從而反映出表型的巨大差異。並且在近代以前的相當長時期內,幾乎不存在任何交流,當然這指的是基因的交流,兩個群體各自獨立的演化,基因頻率間的差異就保持下來,就像例子中黃色和藍色區域那樣,兩個群體間差異巨大。而種群內部,比如我們亞洲人,盡管我們中國人和日本人,韓國人,甚至漢族和少數民族之間也存在著基因頻率的差異,但是不像和歐洲人的差異那麼大。就好比圖中藍色區域內「JD」,「PT」,「JL」等不同種源地間也存在著細微的差異(黃色「血統」所佔比例略有變化)。
再看圖中「PT"中有一個個體比較特別,它的黃色和藍色比值接近1:1,那麼這個個體很可能是一個外來者,或者是由一個藍色「血統」和一個黃色「血統」的親本雜交產生的後代。

Structure 所需要的最基本的數據格式如下:

表中第一行 loc_a, loc_b, loc_c表示位點或標記, 第一列表示樣本,第二列表示種源地或亞群,若沒有這類信息則全部以1代替。對於二倍體來說,每個樣本的基因型由相鄰的兩行表示,每列為一個locus,每行為其中一個allele。
這里只做了簡單的介紹,詳細信息參考軟體使用手冊: Structure documentation

將整理好的基因型數據導入Structure,設置參數「Number of MCMC Reps」, 「burn-in period」, 「length of burn-in period」。
由於該軟體所採用的演算法是一個隨機過程,因此,對於每一個K,需要進行多次重復運算以保證結果的可靠性。

將結果打包,提交給在線軟體 Structure harvester ,分析最佳的K值。

使用 CLUMPP 對structure分析的重復運算結果進行重復抽樣分析。得到最佳K值的Q-matrix結果。

將CLUMPP的結果傳遞給 distruct ,進行structure圖形的繪制。

重點來了 ,由於以上步驟過於繁瑣,且經常要進行此類分析,本著 一切繁瑣的,或重復的勞動都應該自動化 的原則,我對以上軟體進行了深度封裝,只需提供structure格式的文件及配置文件即可一鍵搞定,不需要人為干預,包括K值的選擇,軟體會自動完成。

目前只完成了formatting數據格式轉換和structure兩個模塊。

該模塊將我們的SSR分析結果轉換成多種其他軟體需要的數據格式。

只需要提供config 文件

運行程序

將直接得到structure harvester的結果和最終的structure結果:

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