⑴ Image J軟體分析western blot條帶的求助。急!!!
把條帶圈出來然後點測量 就是measure 出來的那個mean的數值就是灰度 應該說是白度值 條帶越深數值越小
⑵ graphpad prism分析WB條帶
准備工具
1.Photoshop 2.Image J
3. SPSS 4. GraphPad Prism 6
如果你拿到的是藍色的條帶,如下圖:
那我們就需要變個色,弄成黑白的。然後製作成待發表用的圖片。當然有些小夥伴現在用化學發光儀曝光的,WB條帶就是黑白的,處理起來就方便一點。
01 去色
文件→打開圖片,圖像→調整→去色
02 新建畫布 文件→新建
畫布大小:高度,寬度建議大於10厘米,15厘米都可以,畫布建大了沒關系,後面可以剪切,建小了不方便操作。
03
復制,粘貼條帶
矩形選擇工具選擇條帶,然後快捷鍵:Ctrl+C,復制所選的條帶,Ctrl+V,粘貼到剛才新建的畫布上。
04 調整條帶大小
我們有時候復制過來的條帶不一樣大小或者不齊,這個時候我們就需要調整,快捷鍵:Ctrl+T,拉拽條帶至合適大小即可。
05 添加文字標注
條帶對齊之後,要給條帶做標注。選擇橫排文字工具。上面菜單欄可以調節字體的大小,字體,顏色。字體我們一般選擇Times New Roman,適用於發表的要求。
06 合並圖層
讓剛才做好的幾個圖層合並成一張圖片。這里先保存一張TIF格式的圖片(包含所有圖層),方便以後修改。文件→另存為。
調節圖片亮度/對比度,可以自己慢慢調整到適當數值,讓條帶更好看。
(調整前) (調整後) 07 裁剪圖片 註:
1.在合並圖層要先保存tif格式的圖片,方便以後修改;
2.保存為jpg格式是用於發表用的。
08 Image J
得到了做好的WB圖片後要測條帶的灰度值,當然Photoshop也可以測量灰度值,我個人覺得用Image J更專業也比較方便。(實際上是我不會,O(∩_∩)O哈哈~)
09
Image J測WB條帶灰度值
⑶ 如何使用IPP6.0 軟體分析Western blot 條帶
打開IPP6.0軟體,導入預先跑出的Western blot 條帶 點擊工具欄上的Measure-Count/Size,在Count/Size界面中的Measure中選擇Select measurements 進行選擇IOD參數 在工具欄上選擇不規則AOI,將每個條帶使用不規則圖形圈起來以便統計。方法如下:點擊條帶中的第一個條帶,隨後按住Ctrl鍵點擊下一個條帶,依次類推,圈住最後一個條帶時點擊滑鼠右鍵完成選擇。 在Count/Size界面中點擊CountJ鍵,軟體就會自動對條帶進行灰度計算 在Count/Size界面中點擊View中的Measurement Data,查看統計結果,即IOD值,隨後將每個條帶相對應的IOD值導入至excel中。
⑷ 請問在做完western blot 後,通過曝光得到的圖片,用什麼軟體分析,且如何分析可以得到光密度值呢
quantity one可以做,但只是一個定性測量。具體軟體和使用方法可以再DXY中找到。