① metastats差異分析 什麼軟體
meta分析軟體是一款相當實用的專業化Meta分析軟體。
ReviewManager正式版功能全面,提供了大綱、文摘、背景、目的、納入標准、檢索策略、系統評價方法、納入研究的描述、納入研究的方法學質量、結果、討論、結論等項目,ReviewManager讓您的分析更加便捷。
② 常見的三個Meta分析注冊平台(一)
Meta分析的注冊不是必須的,但是很多情況下審稿人會提出這樣的問題,要求作者進行Meta分析的注冊。另一方面,這就類似於生信分析需要額外的補充實驗,RCTs研究需要在clinical.gov注冊一樣,是一種為了規范科研行為的要求。
目前大家了解的注冊平台有3個,分別是: Cochrane圖書館 , PROSPERO平台 ,還有比較新的INPLASY注冊平台。如果想在 Cochrane雜志(IF:7.755) 發表Meta分析,那麼必須在Cochrane圖書館注冊;如果想在 非Cochrane雜志發表(Lancet、NEJM等等) ,那麼就需要用PROSPERO或者INPLASY平台注冊。
首先注冊登錄,隨後我們可以根據需要檢索是否已經有類似的meta分析注冊,或者直接根據PROSPERO的引導式教程進行注冊。
最近因為COVID-19研究的大量湧入,也因為其重要性和緊迫性,所以該平台對於非COVID-19的研究注冊速度極慢。
同樣的流程,注冊登錄,其注冊界面和條目要求類似於PROSPERO。區別在於該平台需要注冊費,詳細可以點擊PAYMENT查看,Price Reced裡面可以查看減免費用的情況(中國也在內)。
對於當前非COVID-19研究在PROSPERO注冊較慢的情況,可以考慮這個較新的平台
上述的一切,都需要作者本人對於什麼是meta分析的protocol以及其具體需要哪些內容有一定的了解。對於Cochrane圖書館的注冊方法因為內容較多,放到下期進行介紹。
③ 各種數據類型meta在stata中的實現
要對連續性數據進行meta分析,需要提取每篇文章的分組情況、樣本量、均值、標准差。需要初步整理為如下格式,如下圖所示:
對文章效應指標的選擇,目前使用較多的是加權均數差(WMD)和標准均數差(SMD)。
讓原始研究效應估計的精度性決定其在meta分析中的權重,消除了絕對值的大小對分析結果的影響。
WMD在STATA軟體中的計算語句為:nostandard
則表示暴露組和對照組觀察變數的相對大小,可以消除研究中不同測量單位帶來的影響,適用於不同指標來衡量相同結果的meta分析。
SMD在STATA軟體中的計算語句為:Cohen, Hedge, Glass
理論上應該先判斷研究異質性的大小,再根據異質性來選擇分析模型,但在實際操作中,常常先選擇固定效應模型,然後計算異質性,如果異質性不接受,則再選擇隨機效應模型。
1)STATA 軟體為 固定效應模型 提供的演算法為倒方差法,實施語句為fixed。
2)STATA 軟體為 隨機效應模型 提供的演算法為I-V heterogeneity法,實施語句為random。
打開STATA軟體的數據錄入界面,將之前收集好的原始數據錄入,如下圖所示
固定效應模型分析語句:
metan n1 mean1 sd1 n2 mean2 sd2, label(namevar=study) texts(180) fixed nostandard
隨機效應模型分析語句:
metan n1 mean1 sd1 n2 mean2 sd2, label(namevar=study) texts(180) random nostandard
將語句輸入STATA的命令對話框,點擊回車後,命令的結果會呈現如下,並自動彈出森林圖。結果如下圖所示:
STATA語句:
metafunnel _ES _seES
將語句輸入STATA的命令對話框,點擊回車後,會自動彈出漏斗圖。結果如圖5所示:
完結
文章研究的結局指標是二分類變數時,頻數可以用2×2的表格呈現,如圖1所示:
對於文章的效應指標的選擇,通常有OR值(比值比),RR值(相對危險度)和RD值(率差)。根據納入文章的研究設計類型選擇合適的分析指標。
1)數據錄入:打開STATA軟體中的數據錄入界面,完成對納入研究數據的錄入。其中a,b,c,d分別代表二分類表中的頻數,如圖2所示:
分析STATA 語句:
固定效應模型:
metan a b c d, or fixed
隨機效應模型:
metan a b c d, or random
將語句輸入STATA的命令對話框,點擊回車後,命令的結果會呈現如下,並自動彈出森林圖。結果如圖3所示:
首先使用的是固定效應模型,語句中lcols(study)用於在森林圖中添加作者姓名和發表年份。結果顯示:Q=5.1, p =0.404>0.05,表明研究間同質性較好,因為 p >0.1,I 2 <40%,故採用固定效應模型分析。最終的分析結果為 p <0.001,表明結果有統計學意義。
STATA繪制的森林圖如圖4所示:
3)繪制漏斗圖
STATA語句:
metafunnel _ES _selogES
將語句輸入STATA的命令對話框,點擊回車後,會自動彈出漏斗圖。結果如圖5所示:
每個散點代表納入的研究,漏斗圖可以直觀地提示發表偏倚。
這就是二分類數據meta初步分析操作流程。
在醫學研究中,多分類數據很常見,例如血型(A型、B型、AB型和O型)。對於無序分類數據的研究,也可進行meta分析,但是 需要將多分類進行重新歸納整理成二分類的數據。 然後採用二分類數據meta分析的方法進行操作,具體過程請筒子們看看文前。
相信大家在面對臨床研究中,遇到過 只有效應量和置信區間的結果數據 ,沒有其他具體描述的,但是郵件又無法聯系原文作者;或者該研究就是源於交叉實驗的效應量、時間事件分析(HR)的研究。面對想好的idea,是不是有點抓狂?不用怕,STATA軟體也可以整合這樣的數據,進行meta分析,下面將向大家介紹。
以 只有HR及其置信區間 的數據為例:
1)首先,關於效應模型的選擇。與前文類似。
2)數據錄入:打開STATA軟體的數據錄入界面,將之前收集好的原始數據錄入,如下圖所示:
其中hr代表文章的風險比(HR)效應值,ll代表HR的95%可信區間的下限,ul代表HR的95%可信區間的上限。
3)數據分析及森林圖繪制:
首先要計算HR和95%可信區間的對數值。因為在meta分析中,通常要求效應差異度量的對應樣本統計量服從正態分布,效應指標是HR,則效應差異度量為HR的對數值。
STATA語句命令為:
等數據轉換完成後,就可以進行meta分析了。STATA的實行語句為:
metan lnhr lnll lnul, eform label(namevar=study) texts(180) effect(HR)
將語句輸入STATA的命令對話框,點擊回車後,命令的結果會呈現如下,並自動彈出森林圖。結果如圖2所示:
其中eform代表結果從HR對數值返回HR值;label(namevar=study)則在表格和森林圖中註明研究信息;texts(180)用於調整森林圖中文字的大小。
結果顯示:
Q=12.88, p =0.116>0.05, 表明研究間同質性較好,因為 p >0.1,I 2 =37.9%,故採用固定效應模型分析。最終的分析結果為 p =0.126>0.05,表明結果無有統計學意義。
彈出的森林圖如圖3所示:
④ meta分析和spss區別
meta分析和spss區別是spss是軟體,meta分析是spss軟體里的一個程序。
1、SPSS(),統計產品與服務解決方案軟體。最初軟體全稱為社會科學統計軟體包。
2、Meta分析包括結局為連續變數、兩分類變數的Meta分析,以及Meta回歸。可信區間的推斷方法還是提供的比較全的。
⑤ meta分析(二)
Meta分析的質量評價
文獻評價方法
文獻的基本信息:如文獻名稱、作者姓名、原始文獻編號和來源、發表日期等。
研究的類型和方法學特徵:如觀察性研究還是試驗性研究。
數據提取基本框架
(三)資料的統計分析
選擇效應量指標(常見)
森林圖
異質性分析
作meta分析首先應當保證臨床同質性,比如研究的設計類型、實驗目的、干預措施等相 同,否則就要進入亞組分析,或者取消合並。
臨床異質性較大時不能行meta分析,隨機效應模型也不行.只能行描述性系統綜述(systemic reviews,SR)或分成亞組消除臨床異質性.解決臨床異質後再考慮統計學異質性的問題.在滿足臨床同質性的前提下(非常重要,不能一味追求統計學同質性,首先考慮專業和臨床同質性),我們進一步觀測統計學同質性。
異質性的識別
如果各個文獻研究間結果不存在異質性(p>0.1),選用固定效應模型(fixed model),這時其實選用隨即效應模型的結果與固定效應模型相同;
如果不符合同質性要求,即異質性檢驗有顯著性意義(p<0.1),這時候固定效>
所以,異質性存在時候要求採用隨機模型,主要是矯正合並效應值的演算法,使得結果更加接近無偏估計,即結果更為准確。
存在異質性可採取措施流程
敏感性分析
常用的方法——分層分析
結果
計算合並效應量(僅供參考現由軟體處理)
發表偏倚的分析
識別發表偏倚的方法
漏斗圖(funnel plots)
三、Meta分析的論文撰寫
重復做meta分析的對策
四、Meta分析常用軟體
⑥ Meta分析入門工具介紹
主要目的是先能夠簡單的復現一些論文的研究方法,按照計劃是了解Revman,stata與R語言的相關分析方法即可。
錨定復現的論文信息為:
論文名稱:Clinical evaluation of prophylactic abdominal aortic balloon occlusion in patients with placenta accreta: a systematic review and meta-analysis
論文地址: https://link.springer.com/article/10.1186%2Fs12884-019-2175-0
針對連續型變數主要使用的數據為關於AABO手術中的失血量的數據:
針對二分類數據,使用AABO手術過程中是否進行子宮切除術(hysterectomy_rate)的相關數據:
RevMan使用上很簡單,簡單記錄下步驟:
Summary產生如下結果:
亞組分析的漏斗圖:
個人安裝的版本為Stata14, 需要安裝相應的包,
如果提示缺少對應的模塊,直接ssc install xxx xxx即可,一般如果網路比較慢,使用手機熱點會比較快點。
在user-Meta Analysis中的括弧中都是模塊名字,可以按照這個名字安裝,比如
相應命令例子:
metan var3 var4 var5 var6 var7 var8, label(namevar=var1, yearvar=var2) random nostandard
相應命令例子:
metan var3 var4 var5 var6, label(namevar=var1, yearvar=var2) by(var1) random nostandard
相應命令例子:
metaninf var3 var4 var5 var6 var7 var8, label(namevar=var1, yearvar=var2) fixed cohen
相應命令例子:
metabias _ES _seES, egger graph
相應命令例子:
metabias _ES _seES, begg
相應命令例子:
metafunnel _ES _seES
相應命令例子:
metareg ES var2 var10 var12, wsse( seES) bsest(reml)
相應命令例子:
metan var3 var4 var5 var6, label(namevar=var1, yearvar=var2) fixed rr
相應命令例子:
metan var3 var4 var5 var6, label(namevar=var1, yearvar=var2) by(var7) fixed rr
相應命令例子:
metaninf var3 var4 var5 var6, label(namevar=var1, yearvar=var2) fixed rr
首先切換數據為log
gen logRR=log(_ES)
相應命令例子:
metabias logRR _selogES , egger graph
相應命令例子:
metabias logRR _selogES, begg
相應命令例子:
metafunnel logRR _selogES
相應命令例子:
回歸過程中變數只能是數字
metareg logRR var2 var8 var10, wsse(_selogES) bsest(reml)
⑦ meta分析都可以用哪些軟體
Meta分析需要的4個軟體及安裝視頻免費在線觀看
鏈接:https://pan..com/s/16zp1wAhUI5MnikRWFRRLKw
Meta分析(Meta-analysis)是用於比較和綜合針對同一科學問題研究結果的統計學方法,其結論是否有意義取決於納入研究的質量,常用於系統綜述中的定量合並分析。與單個研究相比,通過整合所有相關研究,可更精準地估計醫療衛生保健的效果,並有利於探索各研究證據的一致性及研究間的差異性。而當多個研究結果不一致或都無統計學意義時,採用Meta分析可得到接近真實情況的統計分析結果。