『壹』 軟體企業開服務業發票問題
對你公司來說肯定是開服務發票更有利了。而且按此業務的性質來說，提供的是一種充值使用軟體的服務，並不是銷售軟體，開服務發票比較適合。
『貳』 一般納稅人軟體的開發及銷售有收入了怎麼開票
財稅〔2009〕65號：
一、 軟體產品增值稅政策
（一）增值稅一般納稅人銷售其自行開發生產的軟體產品，按17%稅率徵收增值稅後，對其增值稅實際稅負超過3%的部分實行即征即退政策。
（二）增值稅一般納稅人將進口軟體產品進行本地化改造後對外銷售，其銷售的軟體產品可享受本條第一款規定的增值稅即征即退政策。
（三）納稅人受託開發軟體產品，著作權屬於受託方的徵收增值稅，著作權屬於委託方或屬於雙方共同擁有的不徵收增值稅；對經過國家版權局注冊登記，納稅人在銷售時一並轉讓著作權、所有權的，不徵收增值稅。
根據第三項判斷是開具增值稅發票還是營業稅發票。
擴展閱讀：
1、購發票時，持IC卡和發票准購證去稅務局辦理，購買回來後，將IC卡插入讀卡器中，讀入到防偽稅控開票軟體中，用以開具發票時所用。
2、開發票時，首先將IC卡插入讀卡器，然後進入開票系統中進行開具發票的操作(怎樣開發票，你一定會吧?就不詳細說明了)，需要注意的是，電子版的發票與列印的發票用紙必須是同一張發票。
3、進項發票的認證，如果你單位購貨時取得了增值稅發票，月末前持發票的抵扣聯去稅務局進行認證。
4、抄稅，月末終了，根據當地稅務規定的抄稅時限(一般是次月的1-5日)，將本月已經開具使用的發票信息抄入到IC卡中，然後列印出紙質報表並加蓋公章，持IC卡和報表去稅務局大廳進行抄稅。
5、報稅，待財務決算做完後，進行納稅申報表的填寫、審核、報稅的操作，報完稅後，進行申報表的列印，包括主表和附表。此項的操作，都是在你的機器中「增值稅一般納稅人納稅申報電子信息採集系統」軟體中完成的，關於進銷項發票的填寫可以網上下載，既快又准確。季度末，將本季度的申報表主表報送到稅務局。