⑴ Image J软件分析western blot条带的求助。急!!!
把条带圈出来然后点测量 就是measure 出来的那个mean的数值就是灰度 应该说是白度值 条带越深数值越小
⑵ graphpad prism分析WB条带
准备工具
1.Photoshop 2.Image J
3. SPSS 4. GraphPad Prism 6
如果你拿到的是蓝色的条带,如下图:
那我们就需要变个色,弄成黑白的。然后制作成待发表用的图片。当然有些小伙伴现在用化学发光仪曝光的,WB条带就是黑白的,处理起来就方便一点。
01 去色
文件→打开图片,图像→调整→去色
02 新建画布 文件→新建
画布大小:高度,宽度建议大于10厘米,15厘米都可以,画布建大了没关系,后面可以剪切,建小了不方便操作。
03
复制,粘贴条带
矩形选择工具选择条带,然后快捷键:Ctrl+C,复制所选的条带,Ctrl+V,粘贴到刚才新建的画布上。
04 调整条带大小
我们有时候复制过来的条带不一样大小或者不齐,这个时候我们就需要调整,快捷键:Ctrl+T,拉拽条带至合适大小即可。
05 添加文字标注
条带对齐之后,要给条带做标注。选择横排文字工具。上面菜单栏可以调节字体的大小,字体,颜色。字体我们一般选择Times New Roman,适用于发表的要求。
06 合并图层
让刚才做好的几个图层合并成一张图片。这里先保存一张TIF格式的图片(包含所有图层),方便以后修改。文件→另存为。
调节图片亮度/对比度,可以自己慢慢调整到适当数值,让条带更好看。
(调整前) (调整后) 07 裁剪图片 注:
1.在合并图层要先保存tif格式的图片,方便以后修改;
2.保存为jpg格式是用于发表用的。
08 Image J
得到了做好的WB图片后要测条带的灰度值,当然Photoshop也可以测量灰度值,我个人觉得用Image J更专业也比较方便。(实际上是我不会,O(∩_∩)O哈哈~)
09
Image J测WB条带灰度值
⑶ 如何使用IPP6.0 软件分析Western blot 条带
打开IPP6.0软件,导入预先跑出的Western blot 条带 点击工具栏上的Measure-Count/Size,在Count/Size界面中的Measure中选择Select measurements 进行选择IOD参数 在工具栏上选择不规则AOI,将每个条带使用不规则图形圈起来以便统计。方法如下:点击条带中的第一个条带,随后按住Ctrl键点击下一个条带,依次类推,圈住最后一个条带时点击鼠标右键完成选择。 在Count/Size界面中点击CountJ键,软件就会自动对条带进行灰度计算 在Count/Size界面中点击View中的Measurement Data,查看统计结果,即IOD值,随后将每个条带相对应的IOD值导入至excel中。
⑷ 请问在做完western blot 后,通过曝光得到的图片,用什么软件分析,且如何分析可以得到光密度值呢
quantity one可以做,但只是一个定性测量。具体软件和使用方法可以再DXY中找到。