① metastats差异分析 什么软件
meta分析软件是一款相当实用的专业化Meta分析软件。
ReviewManager正式版功能全面,提供了大纲、文摘、背景、目的、纳入标准、检索策略、系统评价方法、纳入研究的描述、纳入研究的方法学质量、结果、讨论、结论等项目,ReviewManager让您的分析更加便捷。
② 常见的三个Meta分析注册平台(一)
Meta分析的注册不是必须的,但是很多情况下审稿人会提出这样的问题,要求作者进行Meta分析的注册。另一方面,这就类似于生信分析需要额外的补充实验,RCTs研究需要在clinical.gov注册一样,是一种为了规范科研行为的要求。
目前大家了解的注册平台有3个,分别是: Cochrane图书馆 , PROSPERO平台 ,还有比较新的INPLASY注册平台。如果想在 Cochrane杂志(IF:7.755) 发表Meta分析,那么必须在Cochrane图书馆注册;如果想在 非Cochrane杂志发表(Lancet、NEJM等等) ,那么就需要用PROSPERO或者INPLASY平台注册。
首先注册登录,随后我们可以根据需要检索是否已经有类似的meta分析注册,或者直接根据PROSPERO的引导式教程进行注册。
最近因为COVID-19研究的大量涌入,也因为其重要性和紧迫性,所以该平台对于非COVID-19的研究注册速度极慢。
同样的流程,注册登录,其注册界面和条目要求类似于PROSPERO。区别在于该平台需要注册费,详细可以点击PAYMENT查看,Price Reced里面可以查看减免费用的情况(中国也在内)。
对于当前非COVID-19研究在PROSPERO注册较慢的情况,可以考虑这个较新的平台
上述的一切,都需要作者本人对于什么是meta分析的protocol以及其具体需要哪些内容有一定的了解。对于Cochrane图书馆的注册方法因为内容较多,放到下期进行介绍。
③ 各种数据类型meta在stata中的实现
要对连续性数据进行meta分析,需要提取每篇文章的分组情况、样本量、均值、标准差。需要初步整理为如下格式,如下图所示:
对文章效应指标的选择,目前使用较多的是加权均数差(WMD)和标准均数差(SMD)。
让原始研究效应估计的精度性决定其在meta分析中的权重,消除了绝对值的大小对分析结果的影响。
WMD在STATA软件中的计算语句为:nostandard
则表示暴露组和对照组观察变量的相对大小,可以消除研究中不同测量单位带来的影响,适用于不同指标来衡量相同结果的meta分析。
SMD在STATA软件中的计算语句为:Cohen, Hedge, Glass
理论上应该先判断研究异质性的大小,再根据异质性来选择分析模型,但在实际操作中,常常先选择固定效应模型,然后计算异质性,如果异质性不接受,则再选择随机效应模型。
1)STATA 软件为 固定效应模型 提供的算法为倒方差法,实施语句为fixed。
2)STATA 软件为 随机效应模型 提供的算法为I-V heterogeneity法,实施语句为random。
打开STATA软件的数据录入界面,将之前收集好的原始数据录入,如下图所示
固定效应模型分析语句:
metan n1 mean1 sd1 n2 mean2 sd2, label(namevar=study) texts(180) fixed nostandard
随机效应模型分析语句:
metan n1 mean1 sd1 n2 mean2 sd2, label(namevar=study) texts(180) random nostandard
将语句输入STATA的命令对话框,点击回车后,命令的结果会呈现如下,并自动弹出森林图。结果如下图所示:
STATA语句:
metafunnel _ES _seES
将语句输入STATA的命令对话框,点击回车后,会自动弹出漏斗图。结果如图5所示:
完结
文章研究的结局指标是二分类变量时,频数可以用2×2的表格呈现,如图1所示:
对于文章的效应指标的选择,通常有OR值(比值比),RR值(相对危险度)和RD值(率差)。根据纳入文章的研究设计类型选择合适的分析指标。
1)数据录入:打开STATA软件中的数据录入界面,完成对纳入研究数据的录入。其中a,b,c,d分别代表二分类表中的频数,如图2所示:
分析STATA 语句:
固定效应模型:
metan a b c d, or fixed
随机效应模型:
metan a b c d, or random
将语句输入STATA的命令对话框,点击回车后,命令的结果会呈现如下,并自动弹出森林图。结果如图3所示:
首先使用的是固定效应模型,语句中lcols(study)用于在森林图中添加作者姓名和发表年份。结果显示:Q=5.1, p =0.404>0.05,表明研究间同质性较好,因为 p >0.1,I 2 <40%,故采用固定效应模型分析。最终的分析结果为 p <0.001,表明结果有统计学意义。
STATA绘制的森林图如图4所示:
3)绘制漏斗图
STATA语句:
metafunnel _ES _selogES
将语句输入STATA的命令对话框,点击回车后,会自动弹出漏斗图。结果如图5所示:
每个散点代表纳入的研究,漏斗图可以直观地提示发表偏倚。
这就是二分类数据meta初步分析操作流程。
在医学研究中,多分类数据很常见,例如血型(A型、B型、AB型和O型)。对于无序分类数据的研究,也可进行meta分析,但是 需要将多分类进行重新归纳整理成二分类的数据。 然后采用二分类数据meta分析的方法进行操作,具体过程请筒子们看看文前。
相信大家在面对临床研究中,遇到过 只有效应量和置信区间的结果数据 ,没有其他具体描述的,但是邮件又无法联系原文作者;或者该研究就是源于交叉实验的效应量、时间事件分析(HR)的研究。面对想好的idea,是不是有点抓狂?不用怕,STATA软件也可以整合这样的数据,进行meta分析,下面将向大家介绍。
以 只有HR及其置信区间 的数据为例:
1)首先,关于效应模型的选择。与前文类似。
2)数据录入:打开STATA软件的数据录入界面,将之前收集好的原始数据录入,如下图所示:
其中hr代表文章的风险比(HR)效应值,ll代表HR的95%可信区间的下限,ul代表HR的95%可信区间的上限。
3)数据分析及森林图绘制:
首先要计算HR和95%可信区间的对数值。因为在meta分析中,通常要求效应差异度量的对应样本统计量服从正态分布,效应指标是HR,则效应差异度量为HR的对数值。
STATA语句命令为:
等数据转换完成后,就可以进行meta分析了。STATA的实行语句为:
metan lnhr lnll lnul, eform label(namevar=study) texts(180) effect(HR)
将语句输入STATA的命令对话框,点击回车后,命令的结果会呈现如下,并自动弹出森林图。结果如图2所示:
其中eform代表结果从HR对数值返回HR值;label(namevar=study)则在表格和森林图中注明研究信息;texts(180)用于调整森林图中文字的大小。
结果显示:
Q=12.88, p =0.116>0.05, 表明研究间同质性较好,因为 p >0.1,I 2 =37.9%,故采用固定效应模型分析。最终的分析结果为 p =0.126>0.05,表明结果无有统计学意义。
弹出的森林图如图3所示:
④ meta分析和spss区别
meta分析和spss区别是spss是软件,meta分析是spss软件里的一个程序。
1、SPSS(),统计产品与服务解决方案软件。最初软件全称为社会科学统计软件包。
2、Meta分析包括结局为连续变量、两分类变量的Meta分析,以及Meta回归。可信区间的推断方法还是提供的比较全的。
⑤ meta分析(二)
Meta分析的质量评价
文献评价方法
文献的基本信息:如文献名称、作者姓名、原始文献编号和来源、发表日期等。
研究的类型和方法学特征:如观察性研究还是试验性研究。
数据提取基本框架
(三)资料的统计分析
选择效应量指标(常见)
森林图
异质性分析
作meta分析首先应当保证临床同质性,比如研究的设计类型、实验目的、干预措施等相 同,否则就要进入亚组分析,或者取消合并。
临床异质性较大时不能行meta分析,随机效应模型也不行.只能行描述性系统综述(systemic reviews,SR)或分成亚组消除临床异质性.解决临床异质后再考虑统计学异质性的问题.在满足临床同质性的前提下(非常重要,不能一味追求统计学同质性,首先考虑专业和临床同质性),我们进一步观测统计学同质性。
异质性的识别
如果各个文献研究间结果不存在异质性(p>0.1),选用固定效应模型(fixed model),这时其实选用随即效应模型的结果与固定效应模型相同;
如果不符合同质性要求,即异质性检验有显着性意义(p<0.1),这时候固定效>
所以,异质性存在时候要求采用随机模型,主要是矫正合并效应值的算法,使得结果更加接近无偏估计,即结果更为准确。
存在异质性可采取措施流程
敏感性分析
常用的方法——分层分析
结果
计算合并效应量(仅供参考现由软件处理)
发表偏倚的分析
识别发表偏倚的方法
漏斗图(funnel plots)
三、Meta分析的论文撰写
重复做meta分析的对策
四、Meta分析常用软件
⑥ Meta分析入门工具介绍
主要目的是先能够简单的复现一些论文的研究方法,按照计划是了解Revman,stata与R语言的相关分析方法即可。
锚定复现的论文信息为:
论文名称:Clinical evaluation of prophylactic abdominal aortic balloon occlusion in patients with placenta accreta: a systematic review and meta-analysis
论文地址: https://link.springer.com/article/10.1186%2Fs12884-019-2175-0
针对连续型变量主要使用的数据为关于AABO手术中的失血量的数据:
针对二分类数据,使用AABO手术过程中是否进行子宫切除术(hysterectomy_rate)的相关数据:
RevMan使用上很简单,简单记录下步骤:
Summary产生如下结果:
亚组分析的漏斗图:
个人安装的版本为Stata14, 需要安装相应的包,
如果提示缺少对应的模块,直接ssc install xxx xxx即可,一般如果网络比较慢,使用手机热点会比较快点。
在user-Meta Analysis中的括号中都是模块名字,可以按照这个名字安装,比如
相应命令例子:
metan var3 var4 var5 var6 var7 var8, label(namevar=var1, yearvar=var2) random nostandard
相应命令例子:
metan var3 var4 var5 var6, label(namevar=var1, yearvar=var2) by(var1) random nostandard
相应命令例子:
metaninf var3 var4 var5 var6 var7 var8, label(namevar=var1, yearvar=var2) fixed cohen
相应命令例子:
metabias _ES _seES, egger graph
相应命令例子:
metabias _ES _seES, begg
相应命令例子:
metafunnel _ES _seES
相应命令例子:
metareg ES var2 var10 var12, wsse( seES) bsest(reml)
相应命令例子:
metan var3 var4 var5 var6, label(namevar=var1, yearvar=var2) fixed rr
相应命令例子:
metan var3 var4 var5 var6, label(namevar=var1, yearvar=var2) by(var7) fixed rr
相应命令例子:
metaninf var3 var4 var5 var6, label(namevar=var1, yearvar=var2) fixed rr
首先切换数据为log
gen logRR=log(_ES)
相应命令例子:
metabias logRR _selogES , egger graph
相应命令例子:
metabias logRR _selogES, begg
相应命令例子:
metafunnel logRR _selogES
相应命令例子:
回归过程中变量只能是数字
metareg logRR var2 var8 var10, wsse(_selogES) bsest(reml)
⑦ meta分析都可以用哪些软件
Meta分析需要的4个软件及安装视频免费在线观看
链接:https://pan..com/s/16zp1wAhUI5MnikRWFRRLKw
Meta分析(Meta-analysis)是用于比较和综合针对同一科学问题研究结果的统计学方法,其结论是否有意义取决于纳入研究的质量,常用于系统综述中的定量合并分析。与单个研究相比,通过整合所有相关研究,可更精准地估计医疗卫生保健的效果,并有利于探索各研究证据的一致性及研究间的差异性。而当多个研究结果不一致或都无统计学意义时,采用Meta分析可得到接近真实情况的统计分析结果。