‘壹’ 软件企业开服务业发票问题
对你公司来说肯定是开服务发票更有利了。而且按此业务的性质来说，提供的是一种充值使用软件的服务，并不是销售软件，开服务发票比较适合。
‘贰’ 一般纳税人软件的开发及销售有收入了怎么开票
财税〔2009〕65号：
一、 软件产品增值税政策
（一）增值税一般纳税人销售其自行开发生产的软件产品，按17%税率征收增值税后，对其增值税实际税负超过3%的部分实行即征即退政策。
（二）增值税一般纳税人将进口软件产品进行本地化改造后对外销售，其销售的软件产品可享受本条第一款规定的增值税即征即退政策。
（三）纳税人受托开发软件产品，着作权属于受托方的征收增值税，着作权属于委托方或属于双方共同拥有的不征收增值税；对经过国家版权局注册登记，纳税人在销售时一并转让着作权、所有权的，不征收增值税。
根据第三项判断是开具增值税发票还是营业税发票。
扩展阅读：
1、购发票时，持IC卡和发票准购证去税务局办理，购买回来后，将IC卡插入读卡器中，读入到防伪税控开票软件中，用以开具发票时所用。
2、开发票时，首先将IC卡插入读卡器，然后进入开票系统中进行开具发票的操作(怎样开发票，你一定会吧?就不详细说明了)，需要注意的是，电子版的发票与打印的发票用纸必须是同一张发票。
3、进项发票的认证，如果你单位购货时取得了增值税发票，月末前持发票的抵扣联去税务局进行认证。
4、抄税，月末终了，根据当地税务规定的抄税时限(一般是次月的1-5日)，将本月已经开具使用的发票信息抄入到IC卡中，然后打印出纸质报表并加盖公章，持IC卡和报表去税务局大厅进行抄税。
5、报税，待财务决算做完后，进行纳税申报表的填写、审核、报税的操作，报完税后，进行申报表的打印，包括主表和附表。此项的操作，都是在你的机器中“增值税一般纳税人纳税申报电子信息采集系统”软件中完成的，关于进销项发票的填写可以网上下载，既快又准确。季度末，将本季度的申报表主表报送到税务局。